Yaşam Bilimleri
Transkriptomik
16S rRNA Kütüphane Hazırlığı
Revvity’nin yeni 16S rRNA kütüphane hazırlama çözümleri, mikrobiyom çalışmalarınıza esneklik kazandırır. Farklı 16S bölgelerini hedefleyen üç kit seçeneği ile düşük girdi (yalnızca 1 ng), hızlı ve güvenilir protokoller sunar.
CosmosID-Hub® ile entegre çalışan analiz platformu sayesinde verilerinizi kolayca analiz edebilir, 384 örneğe kadar çoğullama (multiplexing) yapabilirsiniz. Otomasyon desteği Sciclone™ NGS sistemleri ile uyumludur.
V4, V3-V4 ve V1-V3 bölgelerini kapsayan NEXTFLEX™ kitleri ile araştırmalarınızı bir adım öteye taşıyın.
Tek Hücre Dizileme
Analizde Yeni Nesil Teknoloji: Chromium Platformu
10x Genomics’in Chromium platformu, binlerce hücreyi eş zamanlı ve yüksek doğrulukla inceleme olanağı sunarak araştırmalarda derinlik ve hız kazandırır.
Moleküler Karmaşıklığı Hücre Düzeyinde Çözümleyin
Chromium platformu; transkriptom, epigenetik ve protein düzeyindeki verileri aynı hücre üzerinden elde etmeye olanak sağlar. Bu sayede araştırmacılar, hücresel heterojenliği yüksek çözünürlükte değerlendirebilir ve biyolojik sistemleri daha doğru modelleyebilir.
Temel Özellikler:
- Yüksek Verimli Barkodlama Teknolojisi (GEM): Her hücre için ayrı barkod sayesinde hassas ve izlenebilir veri üretimi.
- Modüler Uygulamalar: Tek hücre RNA-seq, ATAC-seq ve Multiome gibi farklı analiz türlerine uygun kit seçenekleri.
- Düşük Girdi ile Yüksek Çıktı: Minimum örnekle binlerce hücreden zengin veri elde etme imkânı.
- Uygulama Alanları: Onkoloji, immünoloji, nörobilim, kök hücre araştırmaları, gelişimsel biyoloji ve daha fazlası…
Analiz Altyapısıyla Uyumlu
Chromium platformundan elde edilen veriler, güçlü biyoinformatik araçlarla işlenebilir ve bulut tabanlı analiz çözümleri ile desteklenebilir.
Spatial Teknolojileri
Doku morfolojisi ile gen ekspresyon verilerini entegre eden spatial transkriptomik çözümler, hücresel yapıların bağlam içinde anlaşılmasını sağlar.
10x Genomics’in sunduğu iki farklı yaklaşımla, araştırmacılar hem transkriptom düzeyinde geniş kapsamlı hem de hücre içi çözünürlükte hedefe yönelik analizler gerçekleştirebilir.
Visium Spatial Gen Ekspresyon Platformu
Visium, doku kesitleri üzerindeki gen ekspresyonunu konumsal olarak haritalandırmak için tasarlanmış, yüksek verimli bir platformdur. Transkriptom düzeyinde geniş kapsamlı veri elde etmek isteyen araştırmacılar için ideal bir çözümdür.
Öne Çıkan Özellikler:
- Transkriptomik Kapsam: Binlerce genin uzamsal olarak konumlandırılmış ekspresyon analizi
- Morfoloji ile Entegrasyon: Doku görüntüsü ile moleküler verinin eşleştirilmesi
- Taze donmuş veya FFPE örneklerle uyumluluk
- Geniş biyolojik uygulama alanı: Onkoloji, nörobilim, immünoloji, gelişimsel biyoloji ve daha fazlası
Visium ile, bir dokunun genetik aktivite haritasını bütünsel şekilde çıkarabilir, karmaşık biyolojik yapıların mekansal düzenini çözümleyebilirsiniz.
Xenium In Situ Analiz Platformu
Xenium, hücresel ve subhücresel düzeyde uzamsal gen ekspresyonu sağlayan, hedefe yönelik in situ analiz platformudur. Tek hücre çözünürlüğünde transkript tespiti ile hücre altı düzeyde içgörü sunar.
Öne Çıkan Özellikler:
- Hedefe Yönelik Panel Seçenekleri: Belirli gen setlerine özel yüksek hassasiyetli analiz
- Tek hücre ve subhücresel çözünürlük
- Otomatik görüntüleme ve veri toplama altyapısı
- FFPE örnekler ile uyumlu protokol
Xenium, hücre içindeki gen ifadelerini doğrudan yerinde görüntülemenizi sağlayarak doku yapısı içerisindeki biyolojik süreçleri daha derinlemesine anlamanıza yardımcı olur.
Hangi Teknoloji Sizin İçin Uygun?
| Özellik | Visium | Xenium |
|---|---|---|
| Yaklaşım | Transkriptoma dayalı geniş analiz | Hedefe yönelik in situ transkript analizi |
| Örnek uyumluluğu | Taze donmuş & FFPE | FFPE |
| Veri kapsamı | Binlerce gen | Panel bazlı gen seçimi (yüksek sayıda) |
| Çözünürlük | Hücre popülasyonu düzeyinde | Tek hücre ve alt hücresel düzeyde |
RNA Dizileme
SMART (Switching Mechanism at the 5′ end of RNA Template) teknolojisi ile tam RNA sekanslarından kütüphane hazırlığı ile yüksek kalitede yeni nesil dizileme kütüphaneleri hazırlamak artık mümkün.
Takara total RNA, mRNA, small RNA sekanslamaya yönelik farklı kitler ile farklı çalışmalara yönelik çözümler sunar.
Tek Hücre Dizileme
Tek hücre düzeyinde genetik ve transkriptomik analiz yapmak, biyolojik sistemlerin derinlemesine anlaşılmasını sağlar. Illumina Single Cell Prep, yüksek hassasiyetli veri üretimiyle araştırmacılara güçlü ve esnek bir çözüm sunar.
Bu teknoloji, heterojen dokular, nadir hücre popülasyonları ve kompleks hastalıkların araştırılması gibi alanlarda güçlü bir araçtır. Ayrıca CRISPR, epigenomik, proteomik ve DNA/RNA çalışmalarında da kullanılabilir.
100 hücreden 1 milyon hücreye kadar ölçeklenebilir bir yapı sunarak farklı deney ihtiyaçlarına yanıt verir.
Illumina Single Cell Prep, tek hücre düzeyinde hassas ve verimli veri üretimi için tasarlanmış bir süreç sunar. Pre-templated instant partitions (PIPs) teknolojisi sayesinde hücrelerin güvenilir şekilde yakalanmasını ve işlenmesini sağlar.
- Hücre Yakalama (PIP Oluşumu)
Illumina Single Cell Prep kitleriyle hücreler, barkodlanmış şablon partiküllerine (PIP) eklenir. Vortex sistemiyle oluşturulan su-yağ emülsiyonu sayesinde hücreler partiküllerle birleşir. Bu adım esneklik sağlar ve ara verilebilecek bir noktada durdurulabilir. - Lizis
PIP emülsiyonu, kimyasal lizis reaktifiyle birleştirilerek tek hücre damlacıklarına aktarılır. Misel bazlı taşıma mekanizmasıyla reaktif hücre içine taşınır, inkübasyonla lizis gerçekleşir ve mRNA, PIP’ler üzerindeki poly(T)-kaplı boncuklar tarafından yakalanır. - Ters Transkripsiyon
mRNA boncuklara bağlandıktan sonra, PIP’ler çözülür ve özel bir karışımla cDNA’ya dönüştürülür. Bu işlem, her hücreye ait mRNA’nın barkodlanmış cDNA kopyalarının elde edilmesini sağlar. - Kütüphane Hazırlığı
Oluşan cDNA, 5 döngü PCR ile çoğaltılır, endonükleazlarla rastgele kesilir ve dizileme adaptörleri ile bağlanarak NGS’ye hazır hale getirilir. - Veri Analizi
Üretilen veriler, Illumina’nın bulut çözümleri ve Partek yazılımı ile analiz ve görselleştirme için kullanılabilir.